На территории края имеются значительные запасы подземных вод. Их потенциальные эксплуатационные ресурсы в пределах равнинной части края на 50-летний срок составляют 269 м3/сек. На этот же период обеспечены запасами подземных вод г. Барнаул, г. Новоалтайск, г. Славгород, большинство населенных пунктов западной Кулунды. В крае используется менее 20% пресных подземных вод от общих прогнозных эксплуатационных запасов.
В целом запасы подземных и поверхностных водоисточников в крае достаточны для обеспечения потребностей в воде всех водопотребителей на обозримую перспективу.